W lipcu 1937 r. Brytyjczycy zdecydowali się capnąć Mohammada Amina al-Husajni ze względu na jego rolę w środku niedawnej rewolcie. Jednakże udało mu się przedtem zbiec do miejscowości Haram, gdzie był nieprzystępny na rzecz policji. We wrześniu usunięto go z przewodniczenia Najwyższej Radzie Muzułmańskiej dodatkowo uznano zbytnio nielegalną Wyższą Komisję Arabską. W październiku Mohammad Amin al-Husajni przedostał się do Libanu, gdzie reaktywował Komisję poniżej swoim przewodnictwem. Uzyskał wsparcie tamtejszych palestyńskich Arabów. Pozostawał do wnętrza Libanie na wskroś 2 lata, wszak wreszcie francuskie władze zmusiły go do wyjazdu. W październiku 1939 r. udał się do Iraku.